细胞穿膜肽是一种能轻易穿透细胞膜的小分子多肽。这类分子，尤其是具有靶向功能的CPPs，为药物高效传递到靶细胞带来了希望。

因此，对其进行研究具有一定的生物医学意义。本研究主要从序列层面对具有不同穿膜活性的CPPs进行研究，试图找出影响CPPs穿膜活性的因素，以及不同活性CPPs与非穿膜肽(NonCPPs)之间的序列差异，并引入一种分析生物序列的方法。

根据CPPsite数据库和不同文献获得CPPs和NonCPPs序列，并从CPPs序列中提取高、中、低穿膜活性的穿膜肽(HCPPs、MCPPs、LCPPs)，构建数据集，基于这些数据集，进行了以下研究:

1、采用方差分析的方法对不同活性CPPs和NonCPPs的氨基酸和二级结构组成进行分析。研究发现，氨基酸的静电和疏水相互作用对CPPs的穿膜活性有重要影响，螺旋结构和无规卷曲也影响CPPs的穿膜活性;

2、利用不同活性的CPPs的理化性质和长度在二维平面上进行展示，发现在某些特殊性质下，不同活性的CPPs和NonCPPs可以聚类，且HCPPs、MCPPs、LCPPs和NonCPPs被划分为三个聚类，表现出了它们之间差异;

3、本文引入了生物序列的理化质心的概念，将组成序列的残基作为质点，将序列抽象为质点系统进行研究。将该方法应用于CPPs的分析，通过PCA方法，将不同活性的CPPs投影到三维平面上，发现大部分CPPs聚集在一起，部分LCPPs与NonCPPs聚集在一起。

本研究对CPPs的设计和了解不同活性CPPs序列的差异具有一定的意义。此外，本文介绍的生物序列理化质心的分析方法也可用于其他生物问题的分析。同时，它们可以作为一些生物分类问题的输入参数，在模式识别中起到一定的作用。